Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC8A1P32418 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC8A1P32418 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms