Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3AP31941 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms