Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC8P31273 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXC8P31273 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms