Protein–RNA interactions for Protein: P28072

PSMB6, Proteasome subunit beta type-6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB6P28072 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB6P28072 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB6P28072 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB6P28072 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB6P28072 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB6P28072 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB6P28072 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB6P28072 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB6P28072 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB6P28072 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms