Protein–RNA interactions for Protein: P25067

COL8A2, Collagen alpha-2(VIII) chain, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL8A2P25067 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL8A2P25067 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL8A2P25067 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms