Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2B4P23634 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2B4P23634 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B4P23634 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms