Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATF3P18847 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATF3P18847 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATF3P18847 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATF3P18847 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATF3P18847 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATF3P18847 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATF3P18847 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATF3P18847 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ATF3P18847 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATF3P18847 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATF3P18847 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATF3P18847 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATF3P18847 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATF3P18847 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ATF3P18847 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATF3P18847 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATF3P18847 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ATF3P18847 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ATF3P18847 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATF3P18847 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATF3P18847 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATF3P18847 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATF3P18847 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATF3P18847 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATF3P18847 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATF3P18847 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ATF3P18847 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATF3P18847 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATF3P18847 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATF3P18847 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATF3P18847 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATF3P18847 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATF3P18847 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATF3P18847 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATF3P18847 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATF3P18847 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATF3P18847 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATF3P18847 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATF3P18847 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATF3P18847 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATF3P18847 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATF3P18847 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATF3P18847 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATF3P18847 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATF3P18847 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATF3P18847 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATF3P18847 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATF3P18847 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ATF3P18847 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ATF3P18847 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ATF3P18847 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ATF3P18847 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATF3P18847 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATF3P18847 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ATF3P18847 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ATF3P18847 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATF3P18847 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATF3P18847 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATF3P18847 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATF3P18847 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATF3P18847 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATF3P18847 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATF3P18847 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATF3P18847 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATF3P18847 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATF3P18847 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATF3P18847 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATF3P18847 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATF3P18847 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATF3P18847 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATF3P18847 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATF3P18847 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATF3P18847 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATF3P18847 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATF3P18847 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATF3P18847 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATF3P18847 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATF3P18847 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATF3P18847 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ATF3P18847 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ATF3P18847 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ATF3P18847 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATF3P18847 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATF3P18847 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATF3P18847 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATF3P18847 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATF3P18847 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATF3P18847 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATF3P18847 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ATF3P18847 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATF3P18847 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ATF3P18847 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ATF3P18847 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATF3P18847 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATF3P18847 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF3P18847 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF3P18847 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF3P18847 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATF3P18847 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms