Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
H2AFXP16104 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFXP16104 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms