Protein–RNA interactions for Protein: P08456

CHO1, CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CHO1P08456 DPH6YLR143W 2058 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 ACE2YLR131C 2313 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 FLO8YER109C 2400 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 ULS1YOR191W 4860 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YER158W-AYER158W-A 216 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 IRC18YJL037W 675 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YJL147CYJL147C 1149 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 CAP1YKL007W 807 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YML031C-AYML031C-A 336 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YMR087WYMR087W 855 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 SSO2YMR183C 888 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 IST1YNL265C 897 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 MIX23YBL107C 591 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 RRP36YOR287C 903 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 KAR4YCL055W 1008 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YNL011CYNL011C 1335 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 BCS1YDR375C 1371 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 SPC105YGL093W 2754 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 SEG1YMR086W 2883 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 PKP2YGL059W 1476 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 PIG2YIL045W 1617 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 SRP1YNL189W 1629 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YNR065CYNR065C 3351 nt3.58□□□□□ -1.84
CHO1P08456 MCD4YKL165C 2760 nt3.57□□□□□ -1.84
CHO1P08456 BRE4YDL231C 3378 nt3.57□□□□□ -1.84
CHO1P08456 RIM1YCR028C-A 408 nt3.57□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YDR220CYDR220C 294 nt3.57□□□□□ -1.84
CHO1P08456 KEI1YDR367W 666 nt3.57□□□□□ -1.84
CHO1P08456 AGE1YDR524C 1449 nt3.57□□□□□ -1.84
CHO1P08456 MAM1YER106W 909 nt3.57□□□□□ -1.84
CHO1P08456 EMC4YGL231C 573 nt3.57□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YGR117CYGR117C 1431 nt3.57□□□□□ -1.84
CHO1P08456 KIN3YAR018C 1308 nt3.57□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YML053CYML053C 639 nt3.57□□□□□ -1.84
CHO1P08456 RPL18BYNL301C 561 nt3.57□□□□□ -1.84
CHO1P08456 SRP72YPL210C 1923 nt3.57□□□□□ -1.84
CHO1P08456 NUP85YJR042W 2235 nt3.56□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YDL199CYDL199C 2064 nt3.56□□□□□ -1.84
CHO1P08456 VPS45YGL095C 1734 nt3.56□□□□□ -1.84
CHO1P08456 MSM1YGR171C 1728 nt3.56□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YOL019WYOL019W 1656 nt3.56□□□□□ -1.84
CHO1P08456 NOP56YLR197W 1515 nt3.56□□□□□ -1.84
CHO1P08456 CTF13YMR094W 1437 nt3.56□□□□□ -1.84
CHO1P08456 CIT1YNR001C 1440 nt3.56□□□□□ -1.84
CHO1P08456 NRG1YDR043C 696 nt3.56□□□□□ -1.84
CHO1P08456 SPC19YDR201W 498 nt3.56□□□□□ -1.84
CHO1P08456 RMD6YEL072W 696 nt3.56□□□□□ -1.84
CHO1P08456 MAG1YER142C 891 nt3.56□□□□□ -1.84
CHO1P08456 MST27YGL051W 705 nt3.56□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YKL115CYKL115C 393 nt3.56□□□□□ -1.84
CHO1P08456 MST28YAR033W 705 nt3.56□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YLR428CYLR428C 345 nt3.56□□□□□ -1.84
CHO1P08456 UTP23YOR004W 765 nt3.56□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YPL035CYPL035C 348 nt3.56□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YPL278CYPL278C 303 nt3.56□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YBR090CYBR090C 369 nt3.56□□□□□ -1.84
CHO1P08456 HCA4YJL033W 2313 nt3.56□□□□□ -1.84
CHO1P08456 PGS1YCL004W 1566 nt3.55□□□□□ -1.84
CHO1P08456 MRS2YOR334W 1413 nt3.55□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YOR022CYOR022C 2148 nt3.55□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt3.55□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt3.55□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt3.55□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YCL020WYCL020W 1317 nt3.55□□□□□ -1.84
CHO1P08456 MRPL9YGR220C 810 nt3.55□□□□□ -1.84
CHO1P08456 RGI2YIL057C 495 nt3.55□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YLR050CYLR050C 486 nt3.55□□□□□ -1.84
CHO1P08456 BET5YML077W 480 nt3.55□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YNR062CYNR062C 984 nt3.55□□□□□ -1.84
CHO1P08456 SIL1YOL031C 1266 nt3.55□□□□□ -1.84
CHO1P08456 BRX1YOL077C 876 nt3.55□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YOR082CYOR082C 342 nt3.55□□□□□ -1.84
CHO1P08456 PTA1YAL043C 2358 nt3.55□□□□□ -1.84
CHO1P08456 CDC14YFR028C 1656 nt3.55□□□□□ -1.84
CHO1P08456 LOS1YKL205W 3303 nt3.55□□□□□ -1.84
CHO1P08456 GAL11YOL051W 3246 nt3.54□□□□□ -1.84
CHO1P08456 LTV1YKL143W 1392 nt3.54□□□□□ -1.84
CHO1P08456 ESA1YOR244W 1338 nt3.54□□□□□ -1.84
CHO1P08456 ERP3YDL018C 678 nt3.54□□□□□ -1.84
CHO1P08456 UBC13YDR092W 462 nt3.54□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YDR340WYDR340W 303 nt3.54□□□□□ -1.84
CHO1P08456 ECM11YDR446W 909 nt3.54□□□□□ -1.84
CHO1P08456 PRE1YER012W 597 nt3.54□□□□□ -1.84
CHO1P08456 LOC1YFR001W 615 nt3.54□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YHR180WYHR180W 492 nt3.54□□□□□ -1.84
CHO1P08456 AIM22YJL046W 1230 nt3.54□□□□□ -1.84
CHO1P08456 PRP21YJL203W 843 nt3.54□□□□□ -1.84
CHO1P08456 NNF1YJR112W 606 nt3.54□□□□□ -1.84
CHO1P08456 CNB1YKL190W 528 nt3.54□□□□□ -1.84
CHO1P08456 SDS22YKL193C 1017 nt3.54□□□□□ -1.84
CHO1P08456 MRPL16YBL038W 699 nt3.54□□□□□ -1.84
CHO1P08456 RXT2YBR095C 1293 nt3.54□□□□□ -1.84
CHO1P08456 TEL1YBL088C 8364 nt3.54□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YML096WYML096W 1578 nt3.54□□□□□ -1.84
CHO1P08456 HUL5YGL141W 2733 nt3.54□□□□□ -1.84
CHO1P08456 MSK1YNL073W 1731 nt3.53□□□□□ -1.84
CHO1P08456 AIM21YIR003W 2040 nt3.53□□□□□ -1.84
CHO1P08456 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.8 ms