Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR3DP05423 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
POLR3DP05423 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR3DP05423 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms