Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB4AP04350 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB4AP04350 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms