Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF12O95522 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF12O95522 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms