Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNAPINO95295 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNAPINO95295 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms