Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPP2O95045 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPP2O95045 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UPP2O95045 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP2O95045 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP2O95045 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP2O95045 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP2O95045 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP2O95045 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP2O95045 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP2O95045 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP2O95045 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP2O95045 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP2O95045 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP2O95045 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP2O95045 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP2O95045 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP2O95045 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP2O95045 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP2O95045 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPP2O95045 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPP2O95045 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPP2O95045 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPP2O95045 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UPP2O95045 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UPP2O95045 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPP2O95045 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPP2O95045 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
UPP2O95045 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
UPP2O95045 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
UPP2O95045 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
UPP2O95045 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPP2O95045 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPP2O95045 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPP2O95045 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPP2O95045 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPP2O95045 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPP2O95045 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPP2O95045 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPP2O95045 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPP2O95045 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP2O95045 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP2O95045 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP2O95045 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP2O95045 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP2O95045 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP2O95045 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP2O95045 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP2O95045 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP2O95045 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP2O95045 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP2O95045 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP2O95045 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP2O95045 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP2O95045 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP2O95045 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP2O95045 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP2O95045 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP2O95045 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UPP2O95045 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP2O95045 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP2O95045 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP2O95045 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP2O95045 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP2O95045 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP2O95045 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP2O95045 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP2O95045 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP2O95045 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP2O95045 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP2O95045 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP2O95045 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP2O95045 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPP2O95045 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPP2O95045 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPP2O95045 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPP2O95045 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPP2O95045 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPP2O95045 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPP2O95045 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPP2O95045 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP2O95045 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP2O95045 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP2O95045 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP2O95045 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP2O95045 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP2O95045 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP2O95045 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP2O95045 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP2O95045 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP2O95045 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP2O95045 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP2O95045 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP2O95045 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPP2O95045 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPP2O95045 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPP2O95045 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPP2O95045 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPP2O95045 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPP2O95045 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms