Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QR89 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QR89 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QR89 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QR89 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QR89 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QR89 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QR89 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QR89 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QR89 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QR89 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QR89 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QR89 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QR89 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QR89 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3QR89 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
J3QR89 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
J3QR89 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
J3QR89 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QR89 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QR89 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QR89 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QR89 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QR89 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QR89 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QR89 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QR89 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QR89 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QR89 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QR89 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QR89 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QR89 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QR89 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3QR89 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QR89 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QR89 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QR89 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QR89 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QR89 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QR89 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QR89 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QR89 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QR89 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QR89 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QR89 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QR89 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QR89 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QR89 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QR89 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QR89 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QR89 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QR89 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QR89 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QR89 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
J3QR89 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QR89 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QR89 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QR89 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QR89 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QR89 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QR89 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QR89 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QR89 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QR89 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QR89 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QR89 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QR89 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QR89 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QR89 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QR89 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QR89 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QR89 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QR89 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QR89 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QR89 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QR89 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QR89 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QR89 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QR89 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QR89 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QR89 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QR89 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QR89 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QR89 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QR89 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QR89 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QR89 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QR89 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QR89 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QR89 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QR89 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QR89 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QR89 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QR89 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QR89 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QR89 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QR89 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QR89 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QR89 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QR89 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms