Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H7C1W4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
H7C1W4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H7C1W4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H7C1W4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
H7C1W4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H7C1W4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
H7C1W4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
H7C1W4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1W4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1W4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1W4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1W4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1W4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1W4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1W4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1W4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1W4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1W4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1W4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1W4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1W4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1W4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1W4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1W4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1W4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1W4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1W4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1W4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1W4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1W4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1W4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1W4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1W4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1W4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1W4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1W4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1W4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H7C1W4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
H7C1W4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
H7C1W4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
H7C1W4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H7C1W4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H7C1W4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H7C1W4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
H7C1W4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H7C1W4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H7C1W4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
H7C1W4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
H7C1W4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
H7C1W4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
H7C1W4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
H7C1W4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
H7C1W4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
H7C1W4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
H7C1W4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
H7C1W4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
H7C1W4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
H7C1W4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
H7C1W4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
H7C1W4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
H7C1W4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H7C1W4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H7C1W4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H7C1W4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H7C1W4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H7C1W4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H7C1W4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H7C1W4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H7C1W4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H7C1W4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H7C1W4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H7C1W4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H7C1W4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H7C1W4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H7C1W4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H7C1W4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H7C1W4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H7C1W4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H7C1W4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H7C1W4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
H7C1W4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H7C1W4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
H7C1W4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
H7C1W4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H7C1W4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
H7C1W4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H7C1W4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
H7C1W4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
H7C1W4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
H7C1W4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H7C1W4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H7C1W4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
H7C1W4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
H7C1W4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
H7C1W4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
H7C1W4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
H7C1W4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
H7C1W4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
H7C1W4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms