Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCRBV7S3A2A0A539 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms