Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 NUP214-212ENST00000524578 524 ntTSL 33.39□□□□□ -1.878e-9■■■■■ 47.8
UTP3Q9NQZ2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.479e-9■■■■■ 47.8
UTP3Q9NQZ2 PLCD1-202ENST00000417185 685 ntTSL 216.5■□□□□ 0.239e-9■■■■■ 47.8
UTP3Q9NQZ2 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.129e-9■■■■■ 47.8
UTP3Q9NQZ2 PRRC2B-201ENST00000320547 4950 ntTSL 214.21□□□□□ -0.139e-9■■■■■ 47.8
UTP3Q9NQZ2 DDB1-210ENST00000538129 475 ntTSL 27.46□□□□□ -1.229e-9■■■■■ 47.8
UTP3Q9NQZ2 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.29e-9■■■■■ 47.8
UTP3Q9NQZ2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.497e-7■■■■■ 47.8
UTP3Q9NQZ2 KDM3A-202ENST00000409064 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.536e-7■■■■■ 47.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF544-218ENST00000600775 533 ntTSL 413.45□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 47.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF544-210ENST00000597240 555 ntTSL 513.29□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 47.8
UTP3Q9NQZ2 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 47.8
UTP3Q9NQZ2 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 47.8
UTP3Q9NQZ2 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 47.8
UTP3Q9NQZ2 TMBIM6-201ENST00000267115 2836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 47.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF266-206ENST00000592292 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.287e-7■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF266-202ENST00000588221 3503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.727e-7■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.757e-7■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 VARS2-207ENST00000476162 2228 ntTSL 1 (best)17.28■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 VARS2-205ENST00000469358 3429 ntTSL 513.22□□□□□ -0.294e-6■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 MAPK8-207ENST00000395611 5844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.424e-6■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 MAPK8-206ENST00000374189 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.54e-6■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 MAPK8-209ENST00000429041 603 ntTSL 510.93□□□□□ -0.664e-6■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 MCM5-203ENST00000416905 739 ntTSL 314.75□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 MCM5-206ENST00000451351 450 ntTSL 411.07□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 TTL-202ENST00000460450 4148 ntTSL 29.6□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 GSE1-209ENST00000479488 649 ntTSL 216.59■□□□□ 0.253e-18■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 TXNL1-206ENST00000587807 2035 ntTSL 216.77■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 TXNL1-201ENST00000217515 6894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 TXNL1-204ENST00000586262 3541 ntTSL 1 (best)7.1□□□□□ -1.272e-6■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 NADK-205ENST00000460602 974 ntTSL 227.9■■■□□ 2.067e-11■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 NADK-212ENST00000492768 859 ntTSL 327.77■■■□□ 2.047e-11■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 PPT2-EGFL8-207ENST00000585246 1051 ntAPPRIS ALT2 TSL 222.83■■□□□ 1.253e-17■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 NADK-213ENST00000492845 937 ntTSL 218.94■□□□□ 0.627e-11■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 PPT2-EGFL8-205ENST00000479001 944 ntTSL 511.23□□□□□ -0.613e-17■■■■■ 47.7
UTP3Q9NQZ2 PPP2R2A-216ENST00000522150 573 ntTSL 58.5□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 47.6
UTP3Q9NQZ2 PPP2R2A-219ENST00000523473 654 ntTSL 48.5□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 47.6
UTP3Q9NQZ2 SACM1L-203ENST00000433336 678 ntTSL 37.74□□□□□ -1.171e-16■■■■■ 47.6
UTP3Q9NQZ2 SACM1L-211ENST00000464102 3043 ntTSL 24.49□□□□□ -1.691e-16■■■■■ 47.6
UTP3Q9NQZ2 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 47.6
UTP3Q9NQZ2 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 47.6
UTP3Q9NQZ2 TBRG4-212ENST00000483615 822 ntTSL 315.1■□□□□ 0.015e-8■■■■■ 47.6
UTP3Q9NQZ2 VARS2-206ENST00000473916 2000 ntTSL 219.61■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 47.6
UTP3Q9NQZ2 USP15-216ENST00000550632 728 ntTSL 315.62■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 47.6
UTP3Q9NQZ2 USP15-202ENST00000312635 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 47.6
UTP3Q9NQZ2 USP15-212ENST00000549237 791 ntTSL 37.26□□□□□ -1.253e-6■■■■■ 47.6
UTP3Q9NQZ2 SEPT6-206ENST00000460411 1393 ntTSL 223.3■■□□□ 1.323e-7■■■■■ 47.6
UTP3Q9NQZ2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.883e-7■■■■■ 47.6
UTP3Q9NQZ2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.53e-7■■■■■ 47.6
UTP3Q9NQZ2 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.093e-7■■■■■ 47.6
UTP3Q9NQZ2 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 47.6
UTP3Q9NQZ2 SEPT6-205ENST00000394610 4694 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.383e-7■■■■■ 47.6
UTP3Q9NQZ2 SEPT6-203ENST00000354416 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.663e-7■■■■■ 47.6
UTP3Q9NQZ2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 47.5
UTP3Q9NQZ2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 47.5
UTP3Q9NQZ2 SORT1-206ENST00000485149 442 ntTSL 37.25□□□□□ -1.251e-7■■■■■ 47.5
UTP3Q9NQZ2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.329e-7■■■■■ 47.5
UTP3Q9NQZ2 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.119e-7■■■■■ 47.5
UTP3Q9NQZ2 MED15-211ENST00000433831 3267 ntTSL 515.68■□□□□ 0.19e-7■■■■■ 47.5
UTP3Q9NQZ2 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.19e-7■■■■■ 47.5
UTP3Q9NQZ2 SPPL2B-210ENST00000614784 1411 ntTSL 1 (best)19.35■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 47.5
UTP3Q9NQZ2 MYDGF-204ENST00000599761 463 ntTSL 312.96□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 47.5
UTP3Q9NQZ2 DDX5-228ENST00000584279 676 ntTSL 321.45■■□□□ 1.021e-6■■■■■ 47.5
UTP3Q9NQZ2 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.844e-6■■■■■ 47.5
UTP3Q9NQZ2 CYTOR-203ENST00000409139 519 ntTSL 37.51□□□□□ -1.214e-6■■■■■ 47.5
UTP3Q9NQZ2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.497e-7■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.487e-7■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 AIFM1-207ENST00000529877 723 ntTSL 317.46■□□□□ 0.397e-7■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.27e-7■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.027e-7■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.17e-7■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 ARAF-205ENST00000470206 646 ntTSL 58.62□□□□□ -1.037e-7■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 RAD23A-204ENST00000588329 1034 ntTSL 519.21■□□□□ 0.672e-16■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 RAD23A-205ENST00000588826 832 ntTSL 513.87□□□□□ -0.192e-16■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 GRB10-203ENST00000398810 4785 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 TRIM33-203ENST00000448034 2706 ntTSL 56.45□□□□□ -1.388e-7■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.553e-7■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.363e-7■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 LUC7L3-214ENST00000508482 1597 ntTSL 214.25□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 LUC7L3-208ENST00000505658 7040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 NIPBL-202ENST00000448238 8729 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.645e-7■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.695e-7■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.751e-6■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 WDR45B-209ENST00000576517 779 ntTSL 37.41□□□□□ -1.224e-9■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 WDR45B-210ENST00000577774 252 ntTSL 57.31□□□□□ -1.244e-9■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 WDR45B-207ENST00000573656 654 ntTSL 26.97□□□□□ -1.294e-9■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 PPP6R3-204ENST00000393801 5069 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 PPP6R3-203ENST00000393800 5093 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 PPP6R3-201ENST00000265636 4794 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 PPP6R3-205ENST00000524845 2771 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 PPP6R3-202ENST00000265637 4783 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.533e-6■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 PPP6R3-226ENST00000534534 2968 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 PPP6R3-218ENST00000529710 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.893e-6■■■■■ 47.4
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 418.4 ms