Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HCC1Q9Y3T6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
R3HCC1Q9Y3T6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HCC1Q9Y3T6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms