Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH7Q9ULB5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms