Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms