Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTSFQ9UBX1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSFQ9UBX1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms