Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E3

ZNFX1, NFX1-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNFX1Q9P2E3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNFX1Q9P2E3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNFX1Q9P2E3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms