Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKD2L1Q9P0L9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms