Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC59Q9P031 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms