Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX15Q9NRS6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms