Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRC4Q9NPP4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms