Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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FOXQ1Q9C009 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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FOXQ1Q9C009 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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FOXQ1Q9C009 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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FOXQ1Q9C009 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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FOXQ1Q9C009 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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FOXQ1Q9C009 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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FOXQ1Q9C009 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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FOXQ1Q9C009 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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FOXQ1Q9C009 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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FOXQ1Q9C009 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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FOXQ1Q9C009 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FOXQ1Q9C009 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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