Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM31Q9BZY9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms