Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms