Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms