Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms