Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT74Q96LB3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT74Q96LB3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms