Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22AQ96IW7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms