Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms