Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCE1Q969G3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms