Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CLP1Q92989 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLP1Q92989 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms