Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GATA6Q92908 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms