Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSC1Q92574 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms