Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CARMIL3Q8ND23 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms