Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNBD1Q8NA66 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNBD1Q8NA66 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms