Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf62Q8N4C0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf62Q8N4C0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms