Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPAP2Q8IXW5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPAP2Q8IXW5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPAP2Q8IXW5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms