Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLF2Q8IX21 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms