Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC3Q8IVU1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGDCC3Q8IVU1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms