Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNX29P2Q8IUI4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX29P2Q8IUI4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms