Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms