Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FBXO38Q6PIJ6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO38Q6PIJ6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms