Protein–RNA interactions for Protein: Q63HN8

RNF213, E3 ubiquitin-protein ligase RNF213, humanhuman

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Length 5,207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF213Q63HN8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF213Q63HN8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF213Q63HN8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF213Q63HN8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF213Q63HN8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF213Q63HN8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RNF213Q63HN8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RNF213Q63HN8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RNF213Q63HN8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RNF213Q63HN8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RNF213Q63HN8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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