Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GARNL3Q5VVW2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms